COVID-19の研究
Octetプラットフォーム上でのCOVID-19の研究
ザルトリウスでは、SARS-CoV-2ウイルスの治療法やワクチンを見つけるために必要な研究者の世界的な努力を支援することを決定しています。取り組みの一環として、ザルトリウスのOctet®システムが最近の出版物でどのように使用されたか等より詳細な情報へのリンクとリソースを「資料」タブに集約させています。COVID-19の配列が2020年1月に初めて共有されて以来、Octet®システムのデータは、コロナウイルスの生物学、ワクチン、抗ウイルス治療薬の開発に関連する諸々の画期的な出版物で紹介されています。
OctetによるCOVID-19の研究
以下の要約表は、Octet®システムによりCOVID-19ウイルス粒子の結合カイネティクスとアフィニティ、中和、クロスブロッキング、力価を解明した重要な初期研究論文を紹介します。
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Analyte(s) |
Immobilized Ligand(s) |
Virus species |
Assay Focus |
Biosensor |
Reference |
|---|---|---|---|---|---|
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ACE2 |
Fc-tagged SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
Cross-reactivity and receptor binding |
AHC |
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ACE2 |
SARS-CoV-2 SB SARS-CoV SB |
SARS CoV-2 |
Receptor binding |
HIS1K |
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mAb, MERS S protein, VHH |
SARS CoV-2 S1, SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
VHH and mAb binding assessment, Epitope binning |
AR2G |
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Fab, IgG |
SARS CoV-2 S protein, SARS CoV-2 RBS |
SARS CoV-2 |
FAB, IgG binding characterization |
HIS1K |
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ACE2, SARS-CoV RBD |
SARS-CoV-specific neutralizing antibodies |
SARS CoV-2 |
Cross-reactivity binding |
SA |
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Antibodies |
Biotin-Recombinant SARS-CoV S1 protein |
SARS CoV-2 |
Neutralization antibody assessment |
SA |
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FAB, ACE2, SARS S protein |
mAb, ACE2 |
SARS CoV-2 |
Receptor binding, antibody reactivity, competition assays |
AHC, HIS1K |
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SARS CoV-2 RBD |
Inhibitor Peptide |
SARS CoV-2 |
Peptide inhibitor development |
SA |
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mAb |
S1B and SARS Secto domains |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
Antibody reactivity assessment |
HIS1K |
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SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD, mAbs, FAB |
mAbs, SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
Antibody binding characterization, epitope binning, competition binding |
Protein A, HIS2, HIS1K |
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Coronavirus S proteins |
Biotin-9OAc6SLN |
SARS CoV and MERS CoV |
Receptor binding |
SA |
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MERS-5HB fusion inhibitor |
Biotin-peptide (MERS-HR2P) |
MERS CoV |
Protein Inhibitor development |
SA |
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mAb, MERS S protein |
mAb, MERS S protein |
MERS CoV |
Epitope binning and Receptor binding |
SAX, Protein A |
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MERS-CoV S |
mAbs |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements, competition assays |
AHC, HIS1K |
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MERS-CoV NTD, mutants |
mAb |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements |
AHC |
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MERS S-protein |
mAbs |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements |
AHC |
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RBD,S1,S2 domains |
Vaccine-induced mouse monoclonal IgGs |
MERS CoV |
Antibody reactivity and epitope binning |
AHC, HIS1K |
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FABs |
MERS-CoV RBD |
MERS CoV |
Epitope binning |
HIS1K |
Octet BLIプラットフォームは、サイエンティストに以下を提供することでCOVID-19研究の加速化を支援しています：
- 抗原性ターゲット、ワクチン、治療法候補を迅速に選択するためのハイスループットのカイネティクス相互作用解析ソリューション
- 抗体エピトープの特性評価およびカバレッジ決定のための高速かつ柔軟なプラットフォーム
- ワクチンやバイオ治療薬の開発研究に適した多様なバイオセンサーによる効率的なワークフロー
- ワクチンの有効性、安定性、力価測定など、ワクチン開発・製造の上流および下流における多彩なソリューション
- 直感的で使いやすいデータ分析ソフトウェアツール
結合カイネティクスの特性評価
上海復旦大学のYingらは、武漢ウイルス研究所との共同研究において、2019-nCoVとSARS-CoVの受容体結合ドメイン（RBD）の同一性が比較的高いことを考慮し、抗SARS CoV抗体と2019-nCoVスパイクタンパク質との交差反応性を評価しました。その結果、SARS-CoVに特異的なヒトモノクローナル抗体CR3022が、2019-nCoVのRBDと強力に結合することを、Octetシステムで得られたデータを用いて初めて報告しました（KD＝6.3 nM）。このような結果は、効果的な抗ウイルス治療薬やワクチンの最終開発にとって決定的に重要です。
同様の観察結果を、JoyceらがSARS-CoV-2 S RBDの高分解能結晶構造を用いて報告しています。SARS-CoVおよびMERS CoVのRBDと相互作用することが知られている抗体について、Octetシステムを用いてSARS-CoV-2の結合活性を調べました。その結果、2つの抗体 - 240CDとCR3022 - だけが、SARS-CoV 2 RBDに対して低ナノモルの結合親和性を示しました。
復旦大学のYingらは、この他にSARS-CoV-2 RBDを標的としたシングルドメイン抗体の生成とテストについての論文も発表しました。SARS-CoV-2 RBDとS1を抗原として用いてパニングを行った結果、SARS-CoV-2 RBD上の5種類の中和または非中和エピトープを標的とする抗体が同定されました。その中から18個の抗体を選び、さらに研究を進めました。これらの抗体は、SARS-CoV-2 RBDにサブナノモルからナノモルのアフィニティで強力かつ特異的に結合しました（Octet®とELISAで測定）
Yingらは、SARS-Cov-2 RBDを標的としたシングルドメイン抗体に関する論文の中で、18種類のヒトのシングルドメイン抗体をOctetシステムを用いた競合結合アッセイでテストし、それらが互いに競合を示さない3つの競合グループ（グループA、グループB、グループC）に分けられることを発見しました。
世界中の科学者が最近発生したコロナウイルス（COVID-19）の詳細を知るのに、Octetプラットフォーム技術が貢献しています。このパンフレットでは、研究者がワクチン開発の第一歩として、ウイルスの結合メカニズムを理解するためにOctetシステムを使用している多くのケースのうち、2つのケースを紹介しています。
製造中のワクチンの力価測定を迅速かつ正確に行うことは、ワクチン開発プロセスのパフォーマンスを理解し、各プロセスステップを正しくスケーリングするために重要です。Octetプラットフォームは、96-wellまたは384-wellプレートフォーマットのハイスループット特性と、精度と再現性の向上を組み合わせたものであり、よりシンプルで直接的なワクチン/抗原-抗体結合測定法に由来しています。これらは、プロセス開発グループに、SRID法に代わる堅牢かつ簡単な手法を提供します。Octetプラットフォームは、96ウェルプレートのサンプルのアッセイ時間を数日からわずか数時間に短縮します。
ここ数カ月の研究は、SARS CoV-2のS1タンパク質を治療薬のリードターゲットとして注目しています。Aptamer Groupのチームは、SARS CoV-2スパイクタンパク質のS1に選択的に結合できるモノクローナルアプタマーの単離に成功しました。このアプタマーは、Octet Red384システムを用いて、SARS CoV-2とその関連ウイルスに対してテストされ、また、異なる部位でタンパク質に結合するアプタマーも同定されました。
COVID-19のグローバルリサーチ
世界保健機関（WHO）が収集したCovid-19に関するグローバルリサーチを毎日更新しています。. - WHO COVID-19 Literature
アレン人工知能研究所 は主要な研究グループと提携し、COVID-19 Open Research Dataset (CORD-19)を作成・配布しています。このデータベースには、COVID-19およびコロナウイルスファミリーに関する52,000以上の学術論文が収録されており、そのうち41,000以上がフルテキストで掲載されており、世界中の研究者が利用できます。このデータベースのオンライン全文検索は、以下のリンクからアクセスできます。また、ウイルス研究におけるOctet製品の使用について言及している出版物の検索も可能です。- AI Database
COVID-19およびコロナウイルス関連の研究を対象とした、研究者、非営利団体、営利団体向けの公募およびその他の支援の精選リストを管理し、毎日更新しています。- Funding Monitor
アメリカ国立衛生研究所（NIH）が、コロナウイルス関連の資金調達の機会をすべてリストアップしています。 - NIH Funding
