Investigación COVID-19
Investigación de COVID-19 sobre plataformas Octet
Na Sartorius, estamos determinados a apoiar os esforços mundiais de pesquisadores para encontrar as curas e vacinas necessárias para o vírus SARS-CoV-2. Como parte de nosso compromisso, compilamos links e recursos para obter mais informações, incluindo como nossos sistemas de Octet foram usados em publicações recentes na guia Recursos. Desde que a sequência COVID-19 foi compartilhada pela primeira vez em janeiro de 2020, os dados do sistema Octet foram apresentados em várias publicações inovadoras relacionadas à biologia do coronavírus, vacina e desenvolvimento terapêutico antiviral.
Pesquisa Octet® com o COVID-19
A tabela de resumo a seguir fornece alguns artigos de pesquisa importantes onde os sistemas Octet® desempenharam um papel na elucidação da cinética de ligação e afinidade, neutralização, bloqueio cruzado ou título de partículas de vírus COVID-19. Conforme novas informações forem disponibilizadas, atualizaremos esta tabela e outras informações nesta página para fornecer as informações mais recentes.
Analyte(s) |
Immobilized Ligand(s) |
Virus species |
Assay Focus |
Biosensor |
Reference |
---|---|---|---|---|---|
ACE2 |
Fc-tagged SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
Cross-reactivity and receptor binding |
AHC |
|
ACE2 |
SARS-CoV-2 SB SARS-CoV SB |
SARS CoV-2 |
Receptor binding |
HIS1K |
|
mAb, MERS S protein, VHH |
SARS CoV-2 S1, SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
VHH and mAb binding assessment, Epitope binning |
AR2G |
|
Fab, IgG |
SARS CoV-2 S protein, SARS CoV-2 RBS |
SARS CoV-2 |
FAB, IgG binding characterization |
HIS1K |
|
ACE2, SARS-CoV RBD |
SARS-CoV-specific neutralizing antibodies |
SARS CoV-2 |
Cross-reactivity binding |
SA |
|
Antibodies |
Biotin-Recombinant SARS-CoV S1 protein |
SARS CoV-2 |
Neutralization antibody assessment |
SA |
|
FAB, ACE2, SARS S protein |
mAb, ACE2 |
SARS CoV-2 |
Receptor binding, antibody reactivity, competition assays |
AHC, HIS1K |
|
SARS CoV-2 RBD |
Inhibitor Peptide |
SARS CoV-2 |
Peptide inhibitor development |
SA |
|
mAb |
S1B and SARS Secto domains |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
Antibody reactivity assessment |
HIS1K |
|
SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD, mAbs, FAB |
mAbs, SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
Antibody binding characterization, epitope binning, competition binding |
Protein A, HIS2, HIS1K |
|
Coronavirus S proteins |
Biotin-9OAc6SLN |
SARS CoV and MERS CoV |
Receptor binding |
SA |
|
MERS-5HB fusion inhibitor |
Biotin-peptide (MERS-HR2P) |
MERS CoV |
Protein Inhibitor development |
SA |
|
mAb, MERS S protein |
mAb, MERS S protein |
MERS CoV |
Epitope binning and Receptor binding |
SAX, Protein A |
|
MERS-CoV S |
mAbs |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements, competition assays |
AHC, HIS1K |
|
MERS-CoV NTD, mutants |
mAb |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements |
AHC |
|
MERS S-protein |
mAbs |
MERS CoV |
Antibody reactivity measurements |
AHC |
|
RBD,S1,S2 domains |
Vaccine-induced mouse monoclonal IgGs |
MERS CoV |
Antibody reactivity and epitope binning |
AHC, HIS1K |
|
FABs |
MERS-CoV RBD |
MERS CoV |
Epitope binning |
HIS1K |
As plataformas Octet BLI estão ajudando a acelerar a pesquisa COVID-19, fornecendo aos cientistas:
- Soluções de análise de interação cinética de alto rendimento para selecionar alvos antigênicos, vacinas e candidatos terapêuticos rapidamente
- Plataforma rápida e flexível para caracterização de epítopos de anticorpos e determinação de cobertura
- Fluxos de trabalho eficientes com ampla gama de biossensores adaptados para pesquisas de desenvolvimento de vacinas e bioterapia
- Soluções versáteis no desenvolvimento e fabricação de vacinas a montante e a jusante, como a potência da vacina, estabilidade e medições de título
- Ferramentas de software de análise de dados intuitivas e fáceis de usar
Caracterização da cinética de ligação
Ying et. al. da Fudan University, Shanghai, em colaboração com outros no Wuhan Institute of Virology supostamente avaliou a reatividade cruzada de anticorpos anti-SARS CoV com a proteína spike 2019-nCoV, considerando a identidade relativamente alta do domínio de ligação ao receptor (RBD) em 2019 -nCoV e SARS-CoV. Eles relataram pela primeira vez, usando dados obtidos no sistema Octet, que um anticorpo monoclonal humano específico para SARS-CoV, CR3022, poderia se ligar potentemente com 2019-nCoV RBD (KD de 6,3 nM). Tais resultados são críticos para o eventual desenvolvimento de vacinas e terapêuticas antivirais eficazes.
Observações semelhantes foram relatadas por Joyce et. al. usando uma estrutura de cristal de alta resolução do SARS-CoV-2 S RBD. Os anticorpos que eram conhecidos por interagir com SARS-CoV e MERS CoV RBD foram testados para a atividade de ligação de SARS-CoV-2 usando um sistema Octet. Apenas dois anticorpos, 240CD e CR3022 fora do pool exibiram baixas afinidades de ligação nano-molar contra o SARS-CoV 2 RBD.
Ying et. al. na Fudan University publicou outro artigo que descreve a geração e o teste de anticorpos de domínio único direcionados ao SARS-Cov-2 RBD. A seleção usando SARS-CoV-2 RBD e S1 como antígenos resultou na identificação de anticorpos direcionados a cinco tipos de epítopos neutralizantes ou não neutralizantes em SARS-CoV-2 RBD. Dezoito deles foram selecionados para estudos posteriores. Eles se ligam potente e especificamente ao SARS-CoV-2 RBD com afinidades subnanomolar a nanomolar, conforme medido por interferometria de bio-camada (BLI) e ELISA
Em seu artigo sobre anticorpos de domínio único direcionados a SARS-Cov-2 RBD, Ying et. al. testaram 18 anticorpos humanos de domínio único em ensaios de ligação de competição usando o sistema Octet e descobriram que eles poderiam ser divididos em três grupos de competição (grupo A, B ou C) que não mostraram qualquer competição entre si.
A tecnologia da plataforma Octet está ajudando cientistas em todo o mundo a aprender mais sobre o recente surto do Coronavirus (COVID-19). Neste folheto, destacamos dois dos muitos casos em que os pesquisadores estão usando o sistema Octet para entender os mecanismos de ligação do vírus como um primeiro passo no desenvolvimento de uma vacina.
Uma determinação rápida e precisa do título da vacina durante a fabricação é importante para compreender o desempenho do processo de desenvolvimento da vacina e para dimensionar corretamente cada etapa do processo. A plataforma Octet combina as características de alto rendimento de um formato de placa de 96 ou 384 poços com melhorias na precisão e reprodutibilidade e é derivada de um método de medição de ligação de vacina / antígeno-anticorpo mais simples e direto. Eles fornecem aos grupos de desenvolvimento de processos uma alternativa robusta e fácil de usar ao método SRID. A plataforma Octet reduz o tempo de ensaio de dias para apenas algumas horas para uma placa de 96 poços de amostras.
Os últimos meses de pesquisa destacaram a proteína S1 do SARS CoV-2 como um alvo líder para a terapêutica. Uma equipe do Aptamer Group isolou com sucesso um aptâmero monoclonal capaz de se ligar seletivamente à proteína S1 do pico de SARS CoV-2. Eles usaram o sistema Octet® Red384 para testar o aptâmero contra SARS CoV-2 e vírus relacionados e também para identificar aptâmeros que se ligam à proteína em diferentes locais.
Investigación global de COVID-19
Pesquisa global sobre Covid-19 coletada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) e atualizada diariamente. - WHO COVID-19 Literature
The Allen Institute for AI fez parceria com importantes grupos de pesquisa para preparar e distribuir o COVID-19 Open Research Dataset (CORD-19), um recurso gratuito de mais de 52.000 artigos acadêmicos, incluindo mais de 41.000 com texto completo, sobre COVID-19 e a família de vírus coronavírus para uso pela comunidade de pesquisa global. A pesquisa online de texto completo do banco de dados pode ser acessada no link abaixo. Uma pesquisa de publicações que fazem referência ao uso de produtos Octet na pesquisa de vírus também pode ser realizada. - AI Database
Uma lista com curadoria de chamadas de financiamento aberto e outro suporte para pesquisadores, organizações sem fins lucrativos e organizações comerciais, especificamente para COVID-19 e pesquisa relacionada ao coronavírus, é mantida e atualizada diariamente. - Funding Monitor
O National Institutes of Health (NIH) lista todas as oportunidades de financiamento relacionadas ao coronavírus.- NIH Funding