SPR de alto rendimento para descoberta de drogas baseadas em fragmentos
- Descoberta de drogas com base em fragmentos de alto rendimento - O sistema Pioneer FE incorpora um modo de alto rendimento que pode testar 768 analitos quanto à cinética / afinidade em uma injeção em 24 horas. O software de sistema especializado inclui um recurso de seleção de acertos para normalização, fusão e análise de fragmentos ou outros conjuntos de dados de triagem para selecionar acertos com precisão.
- Caracterizações cinéticas simplificadas - Com as injeções OneStep, os usuários podem obter valores cinéticos e de afinidade precisos de uma concentração de analito, eliminando a necessidade de executar múltiplas titulações de analito, economizando tempo e erros associados à diluição. As injeções NextStep fornecem um fluxo de trabalho simples para caracterizar ligantes competitivos contra um ligante para capturar o mecanismo de ação.
- Baixo ruído de linha de base, desvio mínimo, alta sensibilidade e taxa de coleta de dados de até 40 Hz - Ruído e desvio de linha de base extremamente baixos permitem a medição de cinética confiável e valores de afinidade para ligantes desafiadores e de alta afinidade. Com até 40 Hz de capacidade de aquisição de dados, os sistemas Pioneer FE são capazes de capturar associações cinéticas muito rápidas e fases de dissociação de uma ampla gama de biomoléculas e pequenos fragmentos de moléculas.
Os sistemas SPR da Pioneer fornecem dados cinéticos de alta qualidade (ka, kd) e medições de afinidade (KD) para caracterizar uma ampla gama de interações biomoleculares de pequenos fragmentos de moléculas a produtos biológicos. As injeções OneStep SPR permitem fluxos de trabalho de ensaio mais rápidos, onde uma única concentração de analito é suficiente para cinética precisa e determinação de afinidade.
Com três canais de detecção, duas proteínas ou ligantes alvo podem ser analisados simultaneamente para ligação com uma superfície utilizada como um canal de referência.
Oferece uma variedade de formatos de recipientes de amostra com capacidade de até duas placas de 384 poços com um tempo de execução autônomo de cerca de 72 horas para realizar telas de ligação grandes.
Os sistemas SPR da Pioneer são equipados com um software de análise de dados integrado e comprovado pela indústria, baseado nas plataformas Scrubber e Clamp. Dados brutos em várias execuções, dias e sensores podem ser combinados e analisados usando algoritmos de vinculação, como site único, vinculação de vários sites, transporte de massa e análise de inibidor irreversível conforme necessário para a análise.
Como o gradiente do analito é gerado nas injeções OneStep, o coeficiente de difusão é calculado para fornecer uma avaliação da agregação, permitindo que os usuários obtenham informações não apenas sobre a cinética e afinidade, mas também sobre a agregação em apenas uma injeção.
O sistema de fluidos da Pioneer é composto por materiais inertes como PEEK, cerâmica e Tefzal proporcionando durabilidade e baixa manutenção.
Aplicações
Triagem de fragmento
O design de medicamentos baseado em fragmentos tornou-se uma plataforma cada vez mais popular para a identificação de candidatos principais em programas de descoberta de medicamentos. A detecção e caracterização de eventos de ligação de fragmento é facilitada por tecnologias biofísicas sensíveis, capazes de detectar interações de baixa afinidade de compostos de baixo peso molecular.
O sistema Pioneer FE tem a sensibilidade e o rendimento necessários para fornecer telas de fragmento completas em bibliotecas de vários milhares de compostos em apenas algumas semanas por alvo.
Caracterização de interações biológicas de alta afinidade
A caracterização da ligação ao alvo é uma etapa analítica essencial para a seleção de produtos biológicos de alta afinidade (KD <1 nM) e altamente específicos, independentemente dos tipos de moléculas. Uma análise cinética descreve ainda os componentes de associação e dissociação que compreendem a interação de afinidade geral. Por exemplo, dois compostos principais podem possuir uma afinidade semelhante (KD) ao seu alvo, mas suas diferenças nas constantes de taxa cinética de associação e dissociação podem ser usadas para estimar qual será mais útil in vivo. A análise precisa dessas constantes de taxa cinética é, portanto, uma informação importante para a seleção de chumbo e predição da eficácia da terapêutica proteica.
O sistema Pioneer FE com injeções de próxima geração melhora a eficiência do processo de caracterização em relação ao SPR tradicional, determinando a cinética e a afinidade em uma única etapa. A injeção de gradiente OneStep de próxima geração presente na plataforma Pioneer aumenta drasticamente a velocidade de caracterização de afinidade, mantendo a precisão e alta confiança nos resultados.
Caracterizar inibidores irreversíveis e medir o compromisso com a covalência
A maioria dos ensaios de inibidores de moléculas pequenas testados com tecnologias de biossensores em tempo real sem rótulo são interações reversíveis, caracterizadas por modelos de taxa cinética comumente usados. No entanto, uma fração significativa de inibidores de enzimas terapêuticas no mercado funciona por meio da modificação covalente do alvo.
O Pioneer FE é uma plataforma SPR que pode ser usada com biossensores de estreptavidina regeneráveis para capturar reversivelmente alvos proteicos e quantificar a eficiência da ligação de inibidores covalentes ao alvo. O método de aplicações de inibidor irreversível do sistema Pioneer FE pode ser usado para determinar o compromisso do composto inibidor com a covalência (Cc) como uma métrica para inibidores irreversíveis.
Publicações em destaque
Faixa de índice de refração | 1.33–1.40 |
Ruído de Curto Prazo | < 0.035 RU |
Corte de peso molecular | < 70 Da |
Faixas de trabalho | ka 102 – 109 M-1 s-1 kd 10-6 – 2.5 s-1 KD ~10-3 – 10-12 M Concentration ~10-3 – 10-12 M |
Capacidade da amostra | 2 racks de amostra |
| Configuração de amostra | 96 frascos, formatos de poços profundos e PCR, microplacas de 384 poços, alto volume personalizado |
| Controle de temperatura da amostra | 4 a 40 ° C (máx. 15 ° abaixo do ambiente) |
| Carregamento de amostra | Automático |
Número de Canais | 3 |
| Volume do canal de fluxo | < 90 nL |
Subtração da curva de referência | Sim |
Volume de injeção | 2–700 μL |
| Injeções simultâneas | Sim, loops de amostra duplos |
Desgaseificação de buffer em linha | Sim |
| Controle de temperatura do sistema | 4–40 ° C (máx. 15 ° abaixo do ambiente) |
Taxa de dados variável | 1–40 Hz |
| Capacidades de automação | > 72 horas de operação autônoma |
Recurso de seleção de acertos Qdat | Sim |
Modo de triagem de alto rendimento | Sim |
Recursos
- Poster: SensiQ Pioneer Drug Discovery Fragments PDF | 112,4 KB
- Octet® SPR Sensor Chip Selection Guide PDF | 591,8 KB
- The Next Generation SPR-Based Interaction Analysis PDF | 273,6 KB
- Fragment-Based Drug Discovery (FBDD) Using Octet® SPR OneStep® and NeXtStep™ Injections PDF | 5,1 MB
- OneStep® Lead Characterization of High Affinity Biologic Interactions PDF | 2,2 MB
